國家工程技術研究中心是國家科技發展計劃的重要組成部分，由國家科技部統籌規劃建設。國家工程技術研究中心建設是在"創新、產業化"方針指引下，探索科技與經濟結合的新途徑，加強科技成果向生產力轉化的中間環節，促進科技產業化；面向企業規模生產的需要，推動集成、配套的工程化成果向相關行業輻射、轉移與擴散，促進新興產業的崛起和傳統產業的升級改造；促進科技體制改革，培養一流的工程技術人才，建設一流的工程化實驗條件，形成我國科研開發、技術創新和產業化基地。截至2019年2月，我院共有國家工程技術研究中心20家。 
　　序號
　　國家工程技術研究中心名稱
　　依托單位
　　1
　　國家網絡新媒體工程技術研究中心
　　聲學研究所
　　2
　　國家生化工程技術研究中心
　　過程工程研究所
　　3
　　國家遙感應用工程技術研究中心
　　遙感應用研究所
　　4
　　國家并行計算工程技術研究中心
　　計算技術研究所
　　5
　　國家高性能計算機工程技術研究中心
　　計算技術研究所
　　6
　　國家專用集成電路設計工程技術研究中心
　　自動化研究所
　　7
　　中國巖土工程研究中心
　　武漢巖土力學研究所
　　8
　　國家衛星定位系統工程技術研究中心
　　測量與地球物理研究所
　　9
　　國家淡水漁業工程技術研究中心 
　　水生生物研究所
　　10
　　國家金屬腐蝕控制工程技術研究中心
　　金屬研究所
　　11
　　國家真空儀器裝置工程技術研究中心
　　沈陽科學儀器中心
　　12
　　國家催化工程技術研究中心
　　大連化學物理研究所
　　13
　　國家光柵制造與應用工程技術研究中心 
　　長春光學精密機械與物理研究所
　　14
　　國家節水灌溉工程技術研究中心
　　水土保持與生態環境研究中心
　　15
　　國家天然藥物工程技術研究中心
　　成都生物研究所
　　16
　　國家光電子晶體材料工程技術研究中心
　　福建物質結構研究所
　　17
　　國家環境光學監測儀器工程技術研究中心 
　　合肥物質院安光所 
　　18
　　國家荒漠-綠洲生態建設工程技術研究中心
　　新疆生態與地理研究所
　　19
　　國家半導體泵浦激光工程技術研究中心 
　　北京國科世紀激光技術有限公司、光電研究院
　　20
　　國家海洋腐蝕防護工程技術研究中心
　　海洋研究所